上海集世界最大造船厂集团中国远洋集团、世界最大港口机械设备制造商振华重工集团、国际海事组织亚洲海事技术合作中心等国际和国内航运功能组织为一体，综合能力居世界第一。截至2019年年底，世界100家邮轮公司中有39家，世界五大船舶管理机构中的4家，国际船级社协会正式会员10家，世界前5大邮轮企业在上海设立了地区总部或分支机构。

为促进长江三角洲航运一体化发展，长江三角洲航运创新与发展联盟正式成立。该联盟将建立长三角地区政府、政府和企业之间的协调机制，建立长三角地区航运业信息、政策和机制交流平台，为航运业提供最新的投资项目和政策信息。机构合作将体现在服务管理的一体化上。长三角港口正在探索建设单一窗口，不断完善跨区域报关功能，进一步扩大试点范围，并与长江三角洲运输、铁路、港口、航运等部门信息平台推进长三角单窗口对接。